根据中国科学院和广东省人民政府联合印发的《关于成立散裂中子源工程指挥部、工程经理部的通知》，散裂中子源工程指挥部的组成人员名单如下:
    散裂中子源工程建设领导小组第一次会议于2009年8月21日在广州市召开，经会议审议通过了散裂中子源工程建设领导小组职责及工程指挥部组成人员名单，审议通过了散裂中子源工程经理部职责及工程经理部组成人员名单。2009年9月，中国科学院和广东省人民政府联合印发了《关于成立散裂中子源工程指挥部、工程经理部的通知》，公布了散裂中子源工程指挥部和散裂中子源工程经理部的组成人员名单。

    工程指挥部的职责：
    1、受领导小组委托，负责组织散裂中子源工程建设，指导散裂中子源工程经理部的工作。
    2、协调解决工程建设中遇到的有关问题，并定期向领导小组汇报工作；重大事项及时向领导小组报告。
    3、定期举行工作会议，听取工程经理部的工作汇报，检查工程建设的进展；指挥部会议由总指挥召集召开。